Příprava rozhoduje o výsledku
Penetrace může správně fungovat jen na podkladu, který je soudržný, čistý a suchý. Před aplikací je proto nutné odstranit nesoudržné vrstvy, odlupující se staré nátěry, prach, mastnotu a další nečistoty. Nové omítky musí být dostatečně vyzrálé a povrch nesmí obsahovat vodorozpustné soli. Pokud se na stěně objevují praskliny, dutá místa nebo lokální poškození, je třeba je nejprve opravit a nechat důkladně vyschnout.
Důležitou součástí přípravy je také ochrana všech ploch, které se penetrovat nemají. Zakryjte podlahu, nábytek, rámy, sokly i další citlivé prvky. Přestože se penetrační nátěr obvykle nanáší snadno, zaschlé kapky nebo rozstřik se odstraňují obtížněji než čerstvý materiál. Před samotným nátěrem je vhodné ověřit také savost povrchu. Silně savý podklad obvykle vyžaduje pečlivější postup a někdy i dvě vrstvy.
Na připravený povrch lze penetraci nanášet válečkem, štětcem nebo stříkáním. Volba nástroje závisí na členitosti a rozsahu plochy, vždy však platí, že nátěr má být rozprostřen rovnoměrně a bez louží. Příliš silná vrstva nemusí proniknout do podkladu a může vytvořit nežádoucí film. Naopak vynechaná místa zůstanou savá a později se mohou projevit nerovnoměrným vzhledem malby.